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这些琢磨都是正在短缺基因组序列条目下实行的

归档日期:04-17       文本归类:土瓶草      文章编辑:爱尚语录

  金鱼草(Antirrhinum majus L.)也称龙头花(snapdragon),车前科众年生草本植物,因花似金鱼或龙头而得名,是常睹的盆栽、切花及院子抚玩的园艺花草,正在古罗马时间就已完工了驯化。正在过去的三十年中,金鱼草不停行为分子和发育遗传学的形式作物,许众要害基因是正在金鱼草中被初次创造,包罗MADS家族成员DEF、TCP家族成员CYC、驾驭花瓣外皮细胞样式的MYB基因MIXTA、花色基因ROSEA、VENOSA以及驾驭自交不亲和的SLFs(S-Loucs F-box)等。金鱼草中内正在灵活的转座子促使了基因的离散和领会。然而,迄今为止,这些研讨都是正在匮乏基因组序列条目下举行的,无法研讨这些基因、转座子和性状的举座进化和遗传机闭。

  不日,中邦科学院遗传与发育生物学研讨所薛勇彪研讨组协同梁承志研讨组、John Innes核心Enrico Coen研讨组和华大基因等研讨团队,诈骗第二代Illumina基因组测序平台和第三代PacBio单分子测序身手,集合遗传图谱辅助拼装战略,完工了对栽培金鱼草(Antirrhinum majus cv. JI7)的全基因组序列测定。

  该研讨取得了金鱼草(2n=2x=16)8条染色体的分子序列510Mb,掩盖度为97.12%,说明了37714个卵白编码基因,陈诉了一个近乎无缺的金鱼草基因组。通过对序列的对比领会显示,车前科与茄科正在大约六千二百万年前从其迩来的祖宗处分裂并正在大约四千六百万到四千九百万年前产生了全基因组复制变乱,该全基因组复制对金鱼草中与花过错称性闭连的TCP基因家族进化具有厉重功绩。另外,该研讨创造金鱼草的假S位点(ψS-locus)正在大约2Mb的序列上含有102个基因,此中包蕴37个SLF基因但缺失S-RNase,提示该花柱因子的遗失是栽培金鱼草得到自交亲和性状的首要来由,并创造栽培金鱼草S-位点与野生金鱼草S-位点之间具有高度的共线性。综上,金鱼草基因组的破译将极大加快这个形式生物的基因组学和进化研讨。

  该研讨结果于1月29日正在线发布正在Nature Plants杂志(DOI:10.1038/s4-9)。薛勇彪研讨组李苗苗、张冬芬、张辉,梁承志研讨组高强、马斌,中科院北京基因组研讨所骆迎峰和华大基因陈春海为论文的配合第一作家,薛勇彪、梁承志、Enrico Coen和华大基因尹烨为论文的配合通信作家。该研讨取得中科院策略先导项目、邦度科技部及邦度自然科学基金委的经费援救。

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